Dodnes sa bádateľom nepodarilo úplne rozlúštiť neznámy jazyk, v ktorom bol napísaný Voynichov rukopis starý približne 500 rokov.
Voynichov rukopis je ručne písaný záznam a je pomenovaný po Wilfridovi Michaelovi Voynichovi, ktorý záhadný rukopis získal v roku 1912. Je napísaná zatiaľ neidentifikovaným písmom v neznámom jazyku. Okrem ručne písaných poznámok obsahuje útla knižka 303 nakreslených rastlín, ako aj niekoľko astrologických ilustrácií znamení zverokruhu - aj keď s niektorými zvláštnymi črtami.
Mnoho výskumníkov sa už pokúsilo rozlúštiť Voynichov rukopis, ktorý je momentálne uložený na univerzite v Yale – zatiaľ márne. Nielen písmo a jazyk ešte nemožno priradiť, záhadou sú aj ilustrácie. Žiadny z viac ako 300 podrobne opísaných druhov rastlín nie je známy a zaznamenané znamenia zverokruhu vykazujú aj nezvyčajné odchýlky od normy. Postupnosť hviezdneho znamenia začína hviezdnym znamením Rýb, namiesto Barana, ako to bolo vtedy obvyklé. Okrem toho sú dvakrát zobrazené znamenia zverokruhu Baran a Býk, na vyobrazeniach však chýbajú znamenia zverokruhu Vodnár a Kozorožec. Dve chýbajúce znamenia zverokruhu sú pravdepodobne na chýbajúcej strane 74 Voynichovho rukopisu, ktorý obsahuje spolu 102 strán.
Jedno z posledných skúšok knihy sa uskutočnilo v januári 2014. Botanik Arthur O. Tucker a počítačový vedec Rexford H. Talbert sú si istí, že Voynichov rukopis pochádza z Mexika a je napísaný v aztéckom jazyku Nahuati. Ako dôkaz títo dvaja vedci uvádzajú, že 37 z 303 zobrazených rastlín je veľmi podobných rastlinným druhom zo Strednej Ameriky – to sú však tiež len špekulácie. Iní vedci sa domnievajú, že Vaynichov rukopis bol napísaný tajným jazykom, ktorý sa doteraz nepodarilo rozlúštiť.
Skutočnosť, že Voynichov rukopis je čisto fiktívnym záznamom, je však nepochybne vylúčená. Kniha obsahuje približne 170 000 jednotlivých glyfov a približne 35 000 slov. Slová majú všetky fonotaktické vlastnosti iných prirodzených jazykov. Okrem toho slovo frekvencia zodpovedá Zipfovmu zákonu a slovo entropia je podobné latinčine alebo angličtine s približne 10 Shannonmi na slovo. Napriek najmodernejším počítačovým výpočtom sa zatiaľ nepodarilo úspešne priradiť písmo, jazyk, autora či rastlinné ilustrácie.
Ak by bol Voynichov rukopis skutočne napísaný tajným jazykom, jeho rozlúštenie by bolo ešte ťažšie. Možno sú to vedecky zozbierané údaje o vzácnych rastlinách, kniha ezoterických receptov alebo niečo úplne iné. Uvidí sa, či sa niekedy podarí rozlúštiť obsah neznámeho rastlinného druhu. Voynichov rukopis dovtedy určite poskytne dostatok materiálu na špekulácie vo všetkých smeroch.